在针对甲型H1N1流感的治疗过程中，除了接种疫苗的预防和西医的治疗以外，中国传统的中医疗法也发挥了极其重要的作用。
从国内出现第一例甲型H1N1流感患者开始，中医就介入了甲型H1N1流感的治疗之中，在此期间，无论是中医的单独治疗还是中西医结合的疗法都取得了显著地效果。
国家中医药管理局 医政司 司长 许志仁：我们对前一段中医参与治疗的406例病例进行了分析和总结，其中单纯中医治疗的165例，从分析的结果看，中医对发烧、咽痛、咳嗽等症状有明显的改善作用，特别对轻型的甲流患者中医是一种有效的方法。中药和达菲合用对重型的患者也是一种可行的治疗方法。在整个中医药的治疗过程中没有发现不良的反应。
目前，在中国卫生部公布的甲流治疗方案里已将中医治疗甲流纳入方案之中，同时双黄连口服液、莲花清温胶囊等19种中成药和32种中药饮片也已纳入卫生部治疗甲流的用药范围。
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